全省年平均水资源量810亿立方米，其中地表水资源686亿立方米，地下水资源124亿立方米；境内江河湖泊众多，有黑龙江、乌苏里江、松花江、绥芬河四大水系，现有流域面积50平方公里及以上河流2881条，总长度为9.21万公里；现有常年水面面积1平方公里及以上湖泊253个，其中：淡水湖241个，咸水湖12个，水面总面积3037平方公里(不含跨国界湖泊境外面积)。主要湖泊有兴凯湖、镜泊湖、连环湖等湖泊。